El cuidado y protección del medio ambiente ha sido una tarea primordial en las empresas pesqueras de la Región del Bío Bío desde hace muchos años. A raíz de ello, desde 1995 la ASIPES cuenta con un departamento de medio ambiente encargado de prestar apoyo y asesoría a cada una de las compañías socias.

La temática ambiental, presente en cada una de las distintas líneas de producción de la industria pesquera, es abordada por el gremio desde un punto de vista integral, buscando no sólo el cumplimiento legal, sino que el cuidado del medio ambiente y la calidad de vida de las comunidades que rodean esta actividad.

Como todo proceso productivo, la elaboración de productos pesqueros como harina de pescado, conservas y congelados va de la mano de la generación de subproductos y residuos, que la industria ha minimizado en el tiempo con una adecuada gestión medioambiental. Al respecto, las áreas en las que se han centrados todos los esfuerzos son: residuos industriales líquidos, residuos industriales sólidos, olores, material particulado y transporte de pesca.